O prédio onde o Programa está instalado possui vários laboratórios instalados e em pleno funcionamento denominados Laboratório de Ecologia de Pequenos Mamíferos, Laboratório de Ecologia de Invertebrados, Laboratório de Ecologia de Peixes, Laboratório de Ecologia de Populações e Interações, Laboratório de Ecologia Vegetal e Laboratório de Bioinvasões e Conservação. Além destes, três outros laboratórios existem na área de Zoologia e um laboratório na área de Entomologia que apóiam alunos e docentes do programa. Existe também o Laboratório de Estudos e Projetos em Manejo Florestal (LEMAF) que apóia discentes e docentes envolvidos em ecologia da paisagem.
Além disto, está instalado no prédio o Herbário ESAL, que comporta cerca de 23.000 exemplares, principalmente da flora de Minas Gerais. O acervo do herbário encontra-se adequadamente armazenado em estrutura projetada para o mesmo, com armários adquiridos com recursos do Inventário Florestal de Minas Gerais. A médio e longo prazo há espaço físico para duplicar a capacidade de armazenamento instalada no herbário. Entre as coleções mais importantes existentes no Herbário cabe destacar o acervo catalogado a partir do Inventário Florestal de Minas Gerais, coleção referência para os trabalhos com ecologia de florestas desenvolvidos na UFLA. O acervo da herbário está informatizado e o mesmo conta com uma funcionária para o seu funcionamento.
Lista dos Laboratórios:
- Laboratório de Ecologia de Formigas
- Laboratório de Ecologia Subterrânea – Centro de Estudos em Biologia Subterrânea
- Laboratório de Ecologia de Crustáceos
- Laboratório de ecologia e complexidade
- Laboratório de estratégias reprodutivas de plantas herbáceas
- Laboratório de Ecologia de Peixes
- Laboratório de Ecologia Vegetal
- Laboratório de Ecologia e Conservação de Mamíferos
- Laboratório de Melhoramento Florestal e Recursos Genéticos do Departamento de Ciências Florestais Facebook: www.facebook/conservacaogenetica
- Laboratório de ecologia de estradas
- Laboratório de Diversidade e Sistemática de Mamíferos
- A Coleção de Mamíferos da UFLA
- Laboratório de Geoprocessamento e Análise de Imagens do Departamento de Ciências Florestais.
- Laboratório de Ecologia e Conservação de Invertebrados
- Laboratórios do Setor Entomologia Florestal do Departamento de Entomologia: a) Laboratório de estudos de bioecologia de formigas cortadeiras; b) Laboratório de estudos de bioecologia de cupins; c) Laboratório de triagem e identificação de insetos.